서비스를 소개합니다

Targeted Protein Degradation(TPD)은 PROTAC과 같은 bifunctional molecule을 이용하여 표적 단백질을 ubiquitin-proteasome system으로 유도하고 선택적으로 분해하는 새로운 치료제 개발 전략입니다.

Eurofins Discovery의 SPRINTer™ Protein Turnover Assay는 CRISPR technology와 Enzyme Fragment Complementation(EFC) 기술을 기반으로, 세포 내 endogenous target protein의 변화를 직접적이고 민감하게 정량​할 수 있는 cell-based assay platform입니다.

단순한 endpoint 측정을 넘어 약물 처리에 따른 target protein degradation의 potency, efficacy 및 time-dependent kinetics​를 평가할 수 있어 PROTAC을 비롯한 targeted protein degrader의 screening 및 characterization에 활용할 수 있습니다.

Assay Principle

SPRINTer™ Protein Turnover Assay에서는 CRISPR/Cas9 technology를 이용하여 target protein의 endogenous locus에 작은 Enzyme Donor(ED) tag​를 knock-in합니다.

ED-tagged target protein은 detection reagent에 포함된 Enzyme Acceptor(EA)와 결합하여 활성 β-galactosidase enzyme을 형성하며, substrate와 반응하여 chemiluminescent signal을 생성합니다.

PROTAC과 같은 targeted degrader가 target protein과 E3 ligase를 근접시키면 ubiquitination 및 proteasomal degradation이 유도됩니다. 이에 따라 ED-tagged target protein의 양이 감소하고 EFC signal 역시 감소하므로, signal 변화를 통해 endogenous target protein의 degradation을 정량적으로 평가할 수 있습니다.

[Target Protein + Degrader → E3 Ligase Recruitment → Ubiquitination → Proteasomal Degradation → EFC Signal 감소]

Key Features

• Endogenous protein level 직접 측정: CRISPR knock-in을 통해 endogenous target protein의 turnover를 평가합니다.
• High Sensitivity & Rapid Detection: 높은 assay sensitivity를 기반으로 protein degradation의 초기 변화를 빠르게 검출할 수 있습니다.
• Degradation Potency & Efficacy 평가: Dose-response 분석을 통해 degrader 간 potency 및 degradation efficacy를 비교할 수 있습니다.
• Time-dependent Kinetics 분석: 다양한 incubation time에서 측정하여 target degradation kinetics를 비교할 수 있습니다.
• Physiologically Relevant Cell Models: Disease-relevant cell background에서 endogenous protein degradation을 평가할 수 있습니다.
• Screening Application: Homogeneous assay format으로 구성되어 medium-to-high throughput screening에 적용할 수 있습니다.